El Escudo de La Institución Educativa Santa Elena es otro de los principales emblemas; forma parte de la imagen institucional, por lo cual siempre está presente en los actos protocolarios, cívicos, culturales, y se encuentra en la papelería oficial.
El escudo está conformado por una circunferencia de color blanco, la cual nos da el sentido espiralado del crecimiento del ser en forma ascendente, cuyo objetivo es el de proporcionar el desarrollo humano de las personas que interactúan en nuestro contexto. Dentro de la circunferencia se puede leer el nombre de la Institución.  En el interior se puede apreciar un sol que nace de unas montañas, que significa el nacimiento y crecimiento del conocimiento que nos lleva a la sabiduría. 
Las montañas, indican el grado de dificultad que tenemos para lograr el ascenso, porque requiere de tenacidad, esfuerzo, trabajo, compromiso y amor.